上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心是上海市人民政府與美國世界健康基金會（Project HOPE）的合作建設項目。醫院坐落于浦東東方路上，是一所集醫療、科研、教學于一體的兒科醫院，占地100畝，總建筑面積6萬多平方米，核定病床500 張，擁有一流的樓宇自動化設備和完備的醫療保障設施，擔負著上海和全國各地患病兒童以及來華外籍人士子女的醫療工作。

上海兒童醫學中心設有內科、血液腫瘤科、心血管內科、發育與行為科（兒童保健科）、外科、骨科、心胸外科、麻醉科、眼科、五官科、口腔科、皮膚科、中醫 科、影像診斷中心、實驗診斷中心、藥劑科、特診部，開設普通、專家、特需和疑難病門診。 2011年，上海兒童醫院與上海新華醫院兒科、中國兒童醫學研究中心附屬上海鴻慈兒童醫院聯合開展了兒童疑難雜癥方面的合作，使特需和疑難病門診有了很大 的提高。